Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmem87bQ8BKU8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem87bQ8BKU8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tmem87bQ8BKU8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem87bQ8BKU8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.4 ms