Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gabra5Q8BHJ7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gabra5Q8BHJ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gabra5Q8BHJ7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms