Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NfascQ810U3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NfascQ810U3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NfascQ810U3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms