Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc181Q80ZU5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc181Q80ZU5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc181Q80ZU5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.2 ms