Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PhkbQ7TSH2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PhkbQ7TSH2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PhkbQ7TSH2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PhkbQ7TSH2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PhkbQ7TSH2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PhkbQ7TSH2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PhkbQ7TSH2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PhkbQ7TSH2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PhkbQ7TSH2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PhkbQ7TSH2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PhkbQ7TSH2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PhkbQ7TSH2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms