Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Dsg1bQ7TSF1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Dsg1bQ7TSF1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Dsg1bQ7TSF1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms