Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dsg1cQ7TSF0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dsg1cQ7TSF0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms