Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znf250Q7TNU6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znf250Q7TNU6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Znf250Q7TNU6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms