Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Nphp3Q7TNH6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp3Q7TNH6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp3Q7TNH6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms