Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usmg5Q78IK2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usmg5Q78IK2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms