Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc154Q6RUT8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc154Q6RUT8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc154Q6RUT8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms