Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Colgalt2Q6NVG7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Colgalt2Q6NVG7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Colgalt2Q6NVG7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms