Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Kiaa1549Q68FD9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
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Kiaa1549Q68FD9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kiaa1549Q68FD9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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Kiaa1549Q68FD9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Kiaa1549Q68FD9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Kiaa1549Q68FD9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Kiaa1549Q68FD9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Kiaa1549Q68FD9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Kiaa1549Q68FD9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Kiaa1549Q68FD9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Kiaa1549Q68FD9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Kiaa1549Q68FD9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kiaa1549Q68FD9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Kiaa1549Q68FD9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Kiaa1549Q68FD9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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