Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nlrp4fQ66X05 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nlrp4fQ66X05 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nlrp4fQ66X05 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms