Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Zfp248Q640N4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Zfp248Q640N4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Zfp248Q640N4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Zfp248Q640N4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zfp248Q640N4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Zfp248Q640N4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Zfp248Q640N4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Zfp248Q640N4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Zfp248Q640N4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp248Q640N4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms