Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt33bQ61897 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Krt33bQ61897 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33bQ61897 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Krt33bQ61897 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 316.6 ms