Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsg101Q61187 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsg101Q61187 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tsg101Q61187 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tsg101Q61187 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms