Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d1Q60949 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d1Q60949 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms