Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf4Q60722 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tcf4Q60722 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf4Q60722 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms