Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nr2f1Q60632 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nr2f1Q60632 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nr2f1Q60632 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms