Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r196Q5SVD5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms