Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Chsy3Q5DTK1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy3Q5DTK1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy3Q5DTK1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms