Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prss53Q571E5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prss53Q571E5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss53Q571E5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms