Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Khdc1cQ4KL78 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms