Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0F8

Ubn1, Ubinuclein-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubn1Q4G0F8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Ubn1Q4G0F8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubn1Q4G0F8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ubn1Q4G0F8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Ubn1Q4G0F8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Ubn1Q4G0F8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ubn1Q4G0F8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ubn1Q4G0F8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ubn1Q4G0F8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ubn1Q4G0F8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Ubn1Q4G0F8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubn1Q4G0F8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Ubn1Q4G0F8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Ubn1Q4G0F8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Ubn1Q4G0F8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ubn1Q4G0F8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ubn1Q4G0F8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ubn1Q4G0F8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ubn1Q4G0F8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ubn1Q4G0F8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubn1Q4G0F8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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