Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Garnl3Q3V0G7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Garnl3Q3V0G7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms