Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVV9

Vwa3a, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3aQ3UVV9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vwa3aQ3UVV9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vwa3aQ3UVV9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vwa3aQ3UVV9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms