Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
B3gnt6Q3USF0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
B3gnt6Q3USF0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
B3gnt6Q3USF0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms