Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prrc1Q3UPH1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms