Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rapgef1Q3UHC1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rapgef1Q3UHC1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rapgef1Q3UHC1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms