Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc174Q3U155 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc174Q3U155 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms