Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hhla1Q3TYV2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hhla1Q3TYV2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hhla1Q3TYV2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms