Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUL7

Dcaf17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf17Q3TUL7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dcaf17Q3TUL7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dcaf17Q3TUL7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dcaf17Q3TUL7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dcaf17Q3TUL7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dcaf17Q3TUL7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dcaf17Q3TUL7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dcaf17Q3TUL7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dcaf17Q3TUL7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dcaf17Q3TUL7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dcaf17Q3TUL7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dcaf17Q3TUL7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcaf17Q3TUL7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcaf17Q3TUL7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcaf17Q3TUL7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcaf17Q3TUL7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcaf17Q3TUL7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dcaf17Q3TUL7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms