Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Q3TTJ4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q3TTJ4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms