Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc127Q3TC33 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc127Q3TC33 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc127Q3TC33 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc127Q3TC33 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc127Q3TC33 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc127Q3TC33 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms