Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHK6

Gsdmc2, Gasdermin-C2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmc2Q2KHK6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gsdmc2Q2KHK6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gsdmc2Q2KHK6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gsdmc2Q2KHK6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gsdmc2Q2KHK6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gsdmc2Q2KHK6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gsdmc2Q2KHK6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gsdmc2Q2KHK6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gsdmc2Q2KHK6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms