Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rpusd3Q14AI6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rpusd3Q14AI6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms