Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdk18Q04899 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdk18Q04899 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdk18Q04899 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms