Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Aplp1Q03157 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Aplp1Q03157 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Aplp1Q03157 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Aplp1Q03157 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Aplp1Q03157 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Aplp1Q03157 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Aplp1Q03157 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Aplp1Q03157 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aplp1Q03157 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aplp1Q03157 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aplp1Q03157 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms