Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VegfaQ00731 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VegfaQ00731 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VegfaQ00731 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VegfaQ00731 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms