Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeleQ00690 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SeleQ00690 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SeleQ00690 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SeleQ00690 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SeleQ00690 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SeleQ00690 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms