Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vgll3P85442 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Vgll3P85442 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Vgll3P85442 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms