Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tbx6P70327 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tbx6P70327 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tbx6P70327 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms