Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aup1P70295 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aup1P70295 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aup1P70295 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aup1P70295 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Aup1P70295 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Aup1P70295 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Aup1P70295 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Aup1P70295 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Aup1P70295 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms