Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Chl1P70232 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Chl1P70232 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chl1P70232 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Chl1P70232 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chl1P70232 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chl1P70232 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chl1P70232 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Chl1P70232 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chl1P70232 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chl1P70232 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chl1P70232 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Chl1P70232 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chl1P70232 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chl1P70232 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chl1P70232 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chl1P70232 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Chl1P70232 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms