Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PrkcbP68404 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PrkcbP68404 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PrkcbP68404 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms