Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf6P62331 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arf6P62331 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Arf6P62331 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf6P62331 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf6P62331 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arf6P62331 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf6P62331 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf6P62331 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf6P62331 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf6P62331 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf6P62331 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf6P62331 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arf6P62331 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf6P62331 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arf6P62331 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms