Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps13P62301 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps13P62301 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps13P62301 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps13P62301 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps13P62301 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps13P62301 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps13P62301 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps13P62301 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps13P62301 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms