Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufm1P61961 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ufm1P61961 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufm1P61961 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms