Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnnP61807 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnnP61807 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SnnP61807 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SnnP61807 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnnP61807 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnnP61807 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnnP61807 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SnnP61807 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnnP61807 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnnP61807 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnnP61807 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SnnP61807 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SnnP61807 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnnP61807 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SnnP61807 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnnP61807 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnnP61807 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnnP61807 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnnP61807 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnnP61807 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnnP61807 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SnnP61807 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnnP61807 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnnP61807 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnnP61807 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SnnP61807 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SnnP61807 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnnP61807 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnnP61807 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnnP61807 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnnP61807 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnnP61807 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnnP61807 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnnP61807 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnnP61807 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SnnP61807 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnnP61807 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnnP61807 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnnP61807 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnnP61807 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnnP61807 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnnP61807 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SnnP61807 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnnP61807 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnnP61807 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnnP61807 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnnP61807 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnnP61807 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnnP61807 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnnP61807 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SnnP61807 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnnP61807 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnnP61807 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnnP61807 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnnP61807 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SnnP61807 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnnP61807 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnnP61807 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnnP61807 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SnnP61807 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SnnP61807 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SnnP61807 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms